iOS应用程序开发中证书的申请和使用过程是比较复杂的。以下是大致的步骤：
1. 在苹果开发者中心注册账户，并向苹果提交应用程序的开发者证书申请。在提交申请时，需要提供自己的开发者账号信息、证书类型等相关信息。
2. 审核通过后，苹果会向你的开发者账户提供相关的开发者证书，包括iOS开发者证书和iOS证书备份。这些证书将保存在你的电脑中。
3. 使用开发者证书创建应用程序安装证书。这些应用程序安装证书将用于在测试设备上安装应用程序。
4. 在Xcode中，创建新项目并与自己的开发者证书相关联。
5. 确定应用程序的bundle identifier。这个标识符是一个唯一的字符串，用于标识你的应用程序。确保该标识符与你的开发者证书相关联。
6. 构建、编译并运行你的应用程序。
7. 如果要在设备上进行测试，则需要使用安装证书在设备上安装应用程序。这可以通过Xcode实现，也可以在iTunes Connect中手动执行。请注意，设备必须事先注册到开发者账户中。
8. 如果要将应用程序上传到App Store进行发布，则需要使用发布证书进行签名。该证书将通过苹果审核并与应用程序相关联。
以上是iOS应用程序开发中证书的申请和使用过程的大致步骤。需要注意的是，证书的申请和使用需要细心且具有耐心。任何一个环节出错都可能导致开发过程的延误。